- в 1993 году обитель посетил Святейший Патриарх Московский и Всея Руси Алексей II;
- в 1998 году главная лестница храма украшена резными деревянными столбами, балясинами, раскрашенными соответственно полихромной гамме фасадов;
- в 1999 году художник Александр Иванович Чашкин и сестры обители расписали трапезную часть храма;
- в 1999 году обитель посетил Святейший Патриарх Московский и Всея Руси Алексей II;
- в 1999 году благословением Святейшего Патриарха Московского и всея Руси Алексея II и Высокопреосвященнейшего Митрополита Коломенского и Крутицкого Ювеналия после прославления святой блаженной старицы Матроны Свято-Троицкому Ново-Голутвину монастырю передана частица ее святых мощей.
- в 2001 году ветхие деревянные перекрытия (полы) в храме заменены на монолитные;
- в 2003 году выложены мозаикой полы храма;
- в 2004 году установлен новый иконостас с храмовой иконой (Пресвятая Троица);
- в 2005 году обитель посетил Святейший Патриарх Московский и Всея Руси Алексей II;
- в 2009 году обитель посетил Святейший Патриарх Московский и всея Руси Кирилл;
- в 2018 году – построена лестница к южному порталу храма;
Все эти работы выполнены по проектам художественных мастерских обители.
.