Монастырь был закрыт к 1920 году, но службу в храме исполняли престарелый архимандрит о. Варсонофий и псаломщица Мария. После его смерти был прислан игумен о. Синезий. При его служении исполнялись службы долгие, как в монастыре, и сюда стекалось много верующих. Пела та же псаломщица Мария. Затем о. Синезий был переведен в церковь Николы Гостинного, а в монастырь были присланы 3-4 монаха, и служили они до закрытия храма в конце 20-х годов.

В корпусах монастыря в разное время размещались – управление уездной и городской милиции, лазарет, затем общежития, коммунальные квартиры. Некоторые постройки перешли в собственность - например, колокольня, проданная в апреле 1934 г. городским финансовым отделом коломенскому патефонному заводу. Церковь Троицы в 1940-1950 годах сдавалась в аренду швейно-ремонтной артели, Покровская – мастерской «Мособлхудфонда». Десятки лет древние здания эксплуатировались на износ. Новые хозяева прорубали дверные проемы, ставили многочисленные перегородки. В начале 80-х годов большая часть жителей была выселена. Разграбленные храмы и корпуса пришли в запустение, монастырское кладбище было осквернено.

Монастырь, закрытый в 1920-х годах, был возвращен Русской Православной Церкви в 1989 году для создания в нем женской общежительной обители.